En 2009 Sergio Ibarra partió al Juan Aurich, el jale de la temporada fue Ysrael Zúñiga que venía de nuevo al equipo tras jugar en Turquía, el equipo mantuvo una regularidad con triunfos apretados de local pero las derrotas de visita acabaron con la ilusión de clasificar a la Copa Sudamericana 2010. En este año el equipo se mudó del Estadio Mariano Melgar al Monumental de la UNSA, Lamentablemente las peleas entre el DT Claudio Techera e Ysrael Zúñiga dividieron al Grupo, Techera renunció y Luis Flores acabó la campaña.